La prima sezione è la Visione della Croce, che raffigura un evento miracoloso che si dice sia avvenuto prima della Battaglia di Ponte Milvio nel 312 d.C. Secondo la leggenda, Costantino ebbe una visione di una croce nel cielo con le parole "in questo segno vincerai". L'affresco mostra Costantino ei suoi soldati che guardano con soggezione la croce.
La seconda sezione è la Battaglia del Ponte Milvio, combattuta tra Costantino e il suo rivale Massenzio nel 312 d.C. L'affresco mostra il momento in cui l'esercito di Costantino trionfa sull'esercito di Massenzio e lo stesso Massenzio cade nel fiume Tevere.
La terza sezione è il Battesimo di Costantino, che si dice sia avvenuto poco dopo la Battaglia di Ponte Milvio. L'affresco mostra Costantino che viene battezzato da papa Silvestro I alla presenza della madre Elena e di altri personaggi importanti.
La quarta sezione è la Donazione di Roma, che raffigura il dono della città di Roma da parte di Costantino a papa Silvestro I. L'affresco mostra Costantino che presenta un cartiglio al papa mentre altre figure assistono.
Anche gli affreschi della Sala di Costantino vogliono celebrare il trionfo della religione cristiana sul paganesimo. Ciò è particolarmente evidente nella sezione finale degli affreschi, che mostra il Trionfo della religione cristiana. L'affresco mostra Cristo al centro, affiancato da santi e angeli, mentre ai bordi sono sparse figure rappresentanti la religione pagana. Questa sezione è spesso vista come un riflesso della vittoria del cristianesimo sulle antiche religioni pagane di Roma.
Uno degli affreschi più importanti della stanza è la Messa di Bolsena, che ritrae un miracolo avvenuto nella città di Bolsena, in Italia. La storia narra che durante una messa, un sacerdote dubitò dell'esistenza della transustanziazione e, mentre sollevava l'ostia, questa iniziò a sanguinare. L'affresco mostra il sacerdote e l'ostia miracolosa circondati da altre figure in soggezione.
Un altro affresco significativo nella sala è la Liberazione di San Pietro, che raffigura la storia biblica della prigionia di San Pietro da parte del re Erode. Secondo la storia, un angelo apparve a San Pietro in carcere e lo aiutò a fuggire. L'affresco raffigura San Pietro condotto fuori dalla sua cella dall'angelo mentre le guardie dormono.
L'incontro di Leone Magno con Attila è un altro notevole affresco nella Stanza di Eliodoro. Raffigura un leggendario incontro tra papa Leone I e Attila l'Unno, che aveva invaso l'Italia nel V secolo. Secondo la leggenda, Attila fu persuaso da Papa Leone a risparmiare Roma dalla distruzione.
L'affresco La Cacciata di Eliodoro dal tempio è il fulcro della sala e raffigura la storia biblica di Eliodoro, inviato dal re di Siria per impossessarsi del tesoro nel tempio di Gerusalemme. La storia racconta che mentre Eliodoro tentava di prendere il tesoro, fu colpito da un'apparizione celeste e costretto a fuggire.
La Disputa sul Santissimo Sacramento raffigura una disputa teologica sull'Eucaristia. L'affresco mostra un gruppo di teologi e santi riuniti attorno ad un altare, che discutono sulla natura dell'Eucaristia. La parte superiore del dipinto mostra Cristo, circondato da angeli, che regge un calice con l'Ostia eucaristica.
L'affresco della Scuola di Atene raffigura i più grandi filosofi e scienziati dell'antica Grecia, tra cui Platone, Aristotele e Pitagora, riuniti nel cortile di un edificio classico. Il dipinto è un omaggio alla passione del Rinascimento per la cultura e l'apprendimento classici.
Questo affresco illustra le tre virtù cardinali - prudenza, fortezza e temperanza - e le tre virtù teologali - fede, speranza e carità. Al centro dell'affresco è raffigurata una figura in trono con una spada, che rappresenta l'allegoria della Legge.
L'ultimo affresco della Sala della Segnatura rappresenta l'allegoria della poesia. Il dipinto ritrae gli dei e le dee delle arti e delle scienze riuniti sul monte Parnaso. Apollo, il dio della poesia, suona la lira e le Muse lo circondano, rappresentando varie discipline artistiche come la storia, l'astronomia e la geometria.
Questo affresco raffigura l'incoronazione di Carlo Magno da parte di papa Leone III il giorno di Natale dell'800 d.C. Il dipinto raffigura Carlo Magno inginocchiato davanti al Papa, che gli pone una corona sul capo, mentre altre figure lo circondano. Questo dipinto simboleggia il rapporto tra il Papato e il Sacro Romano Impero.
Questo affresco raffigura le vicende del processo a papa Leone III, accusato di vari crimini dai suoi nemici. Il dipinto raffigura Leone III che viene assolto dall'intervento di Dio, rappresentato da una mano che emerge dalle nuvole. L'affresco raffigura il trionfo della giustizia sulle false accuse.
L'affresco raffigura lo spegnimento miracoloso di un incendio in un quartiere vicino Basilica di San Pietro. Secondo la tradizione, l'incendio fu spento miracolosamente dal segno della croce fatto da papa Leone IV. Il dipinto ritrae il popolo di Roma che assiste all'evento miracoloso, con alcuni che si inginocchiano in preghiera.
Questo affresco raffigura la battaglia di Ostia, avvenuta nell'849 d.C. La battaglia fu combattuta tra lo Stato Pontificio ei Saraceni, che tentavano di invadere Roma. Il dipinto ritrae la vittoria dello Stato Pontificio sui Saraceni e la protezione di Roma dalla loro invasione.
Le Stanze di Raffaello, conosciute anche come stanze di Raffaello, sono una serie di quattro stanze situate nel Palazzo Vaticano che furono decorate dal famoso artista rinascimentale Raffaello e dai suoi assistenti tra il 1508 e il 1524.
Gli affreschi più famosi delle Stanze di Raffaello sono la "Scuola di Atene" e la "Disputa del Santissimo Sacramento", entrambi collocati nella Sala della Segnatura.
L'affresco della "Scuola di Atene" è significativo perché rappresenta il culmine dell'arte e della filosofia rinascimentale, nonché la sintesi delle idee classiche e cristiane. Il dipinto raffigura famosi filosofi, come Platone e Aristotele, accanto a personaggi del Rinascimento, come Leonardo da Vinci e Michelangelo.
Gli affreschi della Sala di Eliodoro raffigurano l'intervento divino e la protezione della Chiesa. Includono la "Messa di Bolsena", la "Liberazione di San Pietro", l'"Incontro di Leone Magno con Attila" e la "Cacciata di Eliodoro dal tempio".
Gli affreschi della Sala dell'Incendio di Borgo raffigurano eventi importanti della storia della Chiesa e del Papato, tra cui l'"Incoronazione di Carlo Magno", la "Giustificazione di Leone III", l'"Incendio di Borgo" e il "Battaglia di Ostia". Furono dipinti per celebrare il regno di papa Leone X.